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基因檢測(cè)走向臨床,還要打通幾道“關(guān)”?

美國(guó)國(guó)家基因研究院實(shí)驗(yàn)室主任楚文江此前撰文表示,此類危機(jī)之前出現(xiàn)過(guò)3次,而基因檢測(cè)技術(shù)很可能會(huì)帶來(lái)新一輪的醫(yī)療訴訟高峰。孰是孰非之外,如今的基因檢測(cè)產(chǎn)業(yè)還有哪些需要完善的地方?基因檢測(cè)走向臨床還要打通哪幾道“關(guān)”?

日前,一則新聞曝出了湖南長(zhǎng)沙一男嬰因在產(chǎn)前篩查時(shí)未診斷出染色體異常的案例。事實(shí)上,相似案件在2013年的美國(guó)早有發(fā)生——據(jù)《自然》網(wǎng)站登載,一對(duì)俄勒岡州夫婦起訴醫(yī)院在唐氏綜合征產(chǎn)前基因測(cè)試時(shí)由于疏忽導(dǎo)致孩子出生后成為“唐寶”,獲得法院支持,判決醫(yī)院賠付300萬(wàn)美元賠償金。


“從美國(guó)醫(yī)學(xué)的發(fā)展歷程看,大幅改進(jìn)醫(yī)療服務(wù)的新技術(shù)出現(xiàn)后,早期會(huì)引起醫(yī)學(xué)訴訟案例的大幅增加?!泵绹?guó)國(guó)家基因研究院實(shí)驗(yàn)室主任楚文江此前撰文表示,此類危機(jī)之前出現(xiàn)過(guò)3次,而基因檢測(cè)技術(shù)很可能會(huì)帶來(lái)新一輪的醫(yī)療訴訟高峰。孰是孰非之外,如今的基因檢測(cè)產(chǎn)業(yè)還有哪些需要完善的地方?基因檢測(cè)走向臨床還要打通哪幾道“關(guān)”?

基因篩選

缺人才:測(cè)序技術(shù)需匹配高超醫(yī)術(shù)

據(jù)艾瑞咨詢公司發(fā)布的全球二代基因測(cè)序行業(yè)的投研報(bào)告顯示,基因測(cè)序可應(yīng)用于生殖健康、遺傳病檢測(cè)、新藥研發(fā)、腫瘤診斷及治療、心血管疾病等領(lǐng)域。除了產(chǎn)前篩查和胚胎植入前等基因測(cè)序上的應(yīng)用,臨床應(yīng)用市場(chǎng)廣闊。

“基因測(cè)序技術(shù)的發(fā)展在臨床感染性疾病的診治中也越來(lái)越起到關(guān)鍵作用,并且能夠‘挖’出此前不被認(rèn)識(shí)的新型病原體?!睆?fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院感染科主任張文宏講述了“撒網(wǎng)捕魚”的抗感染故事。

一名發(fā)熱待查患者在發(fā)生發(fā)熱、頭痛、視力下降等多重癥狀兩周多之后到華山醫(yī)院就診,此前經(jīng)外院診斷與治療并無(wú)好轉(zhuǎn)。當(dāng)時(shí)華山醫(yī)院已經(jīng)創(chuàng)建起基因組診斷平臺(tái),于是對(duì)該患者的腦嵴液進(jìn)行了基因測(cè)序,以明確病原學(xué)診斷。

張文宏解釋,傳統(tǒng)的病原尋找方法要培養(yǎng)病原體,培養(yǎng)過(guò)程長(zhǎng),而且是對(duì)已知病原體的“定向釣魚”。測(cè)序技術(shù)無(wú)需培養(yǎng),直接篩查樣本中的病原體,“撒網(wǎng)捕魚”地全面檢測(cè)出細(xì)菌、病毒、真菌和寄生蟲等近7000種病原菌。最終發(fā)現(xiàn),是豬皰疹病毒傳播感染了患者,這是首次鑒定并治愈該病毒的跨物種傳播和感染。

“但并不是說(shuō)任何一個(gè)病例都需要基因測(cè)序,是否測(cè)序,測(cè)序朝著哪個(gè)方向走,都需要醫(yī)生根據(jù)豐富的經(jīng)驗(yàn)給出判斷?!睆埼暮暾f(shuō),目前仍存在假陽(yáng)性率等問(wèn)題,部分技術(shù)不僅對(duì)于普通消費(fèi)者來(lái)說(shuō),對(duì)于醫(yī)院來(lái)說(shuō)也是非常昂貴的,因此醫(yī)生基于豐富的臨床實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)而人給出的先期預(yù)判、以及獲得結(jié)果后的專業(yè)判讀都是精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)得以實(shí)現(xiàn)的關(guān)鍵。

然而,新技術(shù)在臨床上的發(fā)展卻遭遇了“不同語(yǔ)系”的尷尬?;?qū)用?、分子水平?duì)于疾病的診斷與此前在病癥水平的診斷很可能完全不同。

缺標(biāo)準(zhǔn):數(shù)據(jù)質(zhì)量影響報(bào)告準(zhǔn)確性

中國(guó)食品藥品檢定研究院副院長(zhǎng)王佑春研究員用“五多”表示下一代基因測(cè)序技術(shù)走向標(biāo)準(zhǔn)化應(yīng)用的難處?!芭c傳統(tǒng)診斷技術(shù)相比,下一代基因測(cè)序技術(shù)檢測(cè)靶點(diǎn)多、通量高、數(shù)據(jù)量多、分析流程多、質(zhì)量控制參數(shù)多?!边@意味著用“整齊劃一”要求每一個(gè)檢測(cè)程序是艱難的。

王佑春簡(jiǎn)要解釋了測(cè)序技術(shù)的內(nèi)容:“下一代基因測(cè)序的診斷由實(shí)驗(yàn)室操作和生物信息學(xué)分析組成,實(shí)驗(yàn)操作部分包括核酸提取、靶序列擴(kuò)增或捕獲,信息學(xué)分析包括讀取數(shù)據(jù)、過(guò)濾數(shù)據(jù)、拼接序列、比對(duì)解讀以及結(jié)果報(bào)告?!?/p>

由于測(cè)序的復(fù)雜性,對(duì)其質(zhì)量評(píng)價(jià)面臨著許多挑戰(zhàn)。此外,與傳統(tǒng)診斷技術(shù)相比,測(cè)序技術(shù)包括的生物信息學(xué)分析部分是此前所未有的,這要求創(chuàng)建新領(lǐng)域的標(biāo)準(zhǔn),例如創(chuàng)建數(shù)字參考品,包括標(biāo)準(zhǔn)序列或由其組成的標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)庫(kù)等。王佑春表示,“當(dāng)創(chuàng)建標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行引導(dǎo),企業(yè)才知道應(yīng)如何生產(chǎn)這樣的試劑,促進(jìn)產(chǎn)業(yè)走向規(guī)范化。”

由于標(biāo)準(zhǔn)的缺失,目前我國(guó)在基因檢測(cè)的數(shù)據(jù)質(zhì)量上令人擔(dān)憂。楚文江此前與國(guó)內(nèi)生物企業(yè)洽談合作后表示,在數(shù)據(jù)質(zhì)量控制方面國(guó)內(nèi)做的還遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠。如果數(shù)據(jù)錯(cuò)了,后期分析、結(jié)果都是在浪費(fèi)時(shí)間。

呼喚監(jiān)管:保障科學(xué)性項(xiàng)目最終勝出

“嚴(yán)格的監(jiān)管表面看起來(lái)似乎阻礙創(chuàng)新,但它可以保證真正具有科學(xué)性的項(xiàng)目最終勝出?!背慕J(rèn)為,中國(guó)的監(jiān)管和行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)相對(duì)比較寬松,早期發(fā)展迅猛,但在一定的時(shí)期內(nèi)需要撥亂反正,要防止醫(yī)學(xué)創(chuàng)新被市場(chǎng)綁架。

據(jù)2015年底全國(guó)性的腫瘤二代測(cè)序?qū)嶒?yàn)室質(zhì)量評(píng)估報(bào)告結(jié)果顯示,其中55%的實(shí)驗(yàn)室是不合格的,甚至22%的實(shí)驗(yàn)室居然得到的是0分。而中國(guó)食品藥品檢定研究院最近做過(guò)的一項(xiàng)樣本封盲檢測(cè)顯示,國(guó)內(nèi)4家測(cè)序企業(yè)對(duì)于同樣的樣本給出的診斷結(jié)果并不一致。楚文江認(rèn)為,目前中國(guó)的基因檢測(cè)還沒(méi)有成熟完整的質(zhì)量監(jiān)管體系,體現(xiàn)在數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性上沒(méi)有保證。而美國(guó)則調(diào)動(dòng)聯(lián)邦政府層面比如美國(guó)食品藥品監(jiān)督管理局和美國(guó)聯(lián)邦醫(yī)療保險(xiǎn)和醫(yī)療救助服務(wù)中心,州政府層面比如各州公共衛(wèi)生部門,以及行業(yè)協(xié)會(huì)等進(jìn)行多重質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)和監(jiān)管。

與楚文江的觀點(diǎn)相似,中國(guó)食品藥品檢定研究院劉東來(lái)等此前撰文梳理了美國(guó)對(duì)實(shí)驗(yàn)室研發(fā)診斷試劑的監(jiān)管之路,文章指出,醫(yī)療機(jī)構(gòu)此前未能得到明確監(jiān)管,直接導(dǎo)致了基因檢測(cè)市場(chǎng)的種種亂象,既無(wú)法保障消費(fèi)者或患者的切身利益,又無(wú)法真正地促進(jìn)技術(shù)創(chuàng)新和行業(yè)發(fā)展。

監(jiān)管需要回答的問(wèn)題包括:檢測(cè)者擁有什么的資質(zhì),采用什么樣的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn),是否定期進(jìn)行熟練測(cè)試等。楚文江認(rèn)為,這些都是患者關(guān)注的問(wèn)題。

越來(lái)越多的獨(dú)立實(shí)驗(yàn)室和公司都在進(jìn)行相關(guān)技術(shù)的研發(fā),這就導(dǎo)致了監(jiān)管范圍需要擴(kuò)大。這也是美國(guó)此前面臨的問(wèn)題。該如何應(yīng)對(duì)?對(duì)監(jiān)管者的考驗(yàn)仍在繼續(xù)。


2019年7月25日-27日,億歐大健康將主辦“GIIS 2019第四屆中國(guó)大健康產(chǎn)業(yè)升級(jí)峰會(huì)”,峰會(huì)以“雁棲健談——從【規(guī)?!康健緝r(jià)值】的醫(yī)療變革”為主題,圍繞醫(yī)療大數(shù)據(jù)、醫(yī)藥創(chuàng)新、非公醫(yī)療和科技醫(yī)療四大細(xì)分領(lǐng)域的市場(chǎng)環(huán)境、投資熱點(diǎn)和產(chǎn)業(yè)變革等話題展開探討。

活動(dòng)報(bào)名鏈接:https://www.iyiou.com/post/ad/id/785

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基因檢測(cè)走向臨床,還要打通幾道“關(guān)”?

時(shí)間 :2022-06-20 來(lái)源: 瀏覽 : 分類 :行業(yè)動(dòng)態(tài)

日前,一則新聞曝出了湖南長(zhǎng)沙一男嬰因在產(chǎn)前篩查時(shí)未診斷出染色體異常的案例。事實(shí)上,相似案件在2013年的美國(guó)早有發(fā)生——據(jù)《自然》網(wǎng)站登載,一對(duì)俄勒岡州夫婦起訴醫(yī)院在唐氏綜合征產(chǎn)前基因測(cè)試時(shí)由于疏忽導(dǎo)致孩子出生后成為“唐寶”,獲得法院支持,判決醫(yī)院賠付300萬(wàn)美元賠償金。


“從美國(guó)醫(yī)學(xué)的發(fā)展歷程看,大幅改進(jìn)醫(yī)療服務(wù)的新技術(shù)出現(xiàn)后,早期會(huì)引起醫(yī)學(xué)訴訟案例的大幅增加。”美國(guó)國(guó)家基因研究院實(shí)驗(yàn)室主任楚文江此前撰文表示,此類危機(jī)之前出現(xiàn)過(guò)3次,而基因檢測(cè)技術(shù)很可能會(huì)帶來(lái)新一輪的醫(yī)療訴訟高峰。孰是孰非之外,如今的基因檢測(cè)產(chǎn)業(yè)還有哪些需要完善的地方?基因檢測(cè)走向臨床還要打通哪幾道“關(guān)”?

基因篩選

缺人才:測(cè)序技術(shù)需匹配高超醫(yī)術(shù)

據(jù)艾瑞咨詢公司發(fā)布的全球二代基因測(cè)序行業(yè)的投研報(bào)告顯示,基因測(cè)序可應(yīng)用于生殖健康、遺傳病檢測(cè)、新藥研發(fā)、腫瘤診斷及治療、心血管疾病等領(lǐng)域。除了產(chǎn)前篩查和胚胎植入前等基因測(cè)序上的應(yīng)用,臨床應(yīng)用市場(chǎng)廣闊。

“基因測(cè)序技術(shù)的發(fā)展在臨床感染性疾病的診治中也越來(lái)越起到關(guān)鍵作用,并且能夠‘挖’出此前不被認(rèn)識(shí)的新型病原體?!睆?fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院感染科主任張文宏講述了“撒網(wǎng)捕魚”的抗感染故事。

一名發(fā)熱待查患者在發(fā)生發(fā)熱、頭痛、視力下降等多重癥狀兩周多之后到華山醫(yī)院就診,此前經(jīng)外院診斷與治療并無(wú)好轉(zhuǎn)。當(dāng)時(shí)華山醫(yī)院已經(jīng)創(chuàng)建起基因組診斷平臺(tái),于是對(duì)該患者的腦嵴液進(jìn)行了基因測(cè)序,以明確病原學(xué)診斷。

張文宏解釋,傳統(tǒng)的病原尋找方法要培養(yǎng)病原體,培養(yǎng)過(guò)程長(zhǎng),而且是對(duì)已知病原體的“定向釣魚”。測(cè)序技術(shù)無(wú)需培養(yǎng),直接篩查樣本中的病原體,“撒網(wǎng)捕魚”地全面檢測(cè)出細(xì)菌、病毒、真菌和寄生蟲等近7000種病原菌。最終發(fā)現(xiàn),是豬皰疹病毒傳播感染了患者,這是首次鑒定并治愈該病毒的跨物種傳播和感染。

“但并不是說(shuō)任何一個(gè)病例都需要基因測(cè)序,是否測(cè)序,測(cè)序朝著哪個(gè)方向走,都需要醫(yī)生根據(jù)豐富的經(jīng)驗(yàn)給出判斷?!睆埼暮暾f(shuō),目前仍存在假陽(yáng)性率等問(wèn)題,部分技術(shù)不僅對(duì)于普通消費(fèi)者來(lái)說(shuō),對(duì)于醫(yī)院來(lái)說(shuō)也是非常昂貴的,因此醫(yī)生基于豐富的臨床實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)而人給出的先期預(yù)判、以及獲得結(jié)果后的專業(yè)判讀都是精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)得以實(shí)現(xiàn)的關(guān)鍵。

然而,新技術(shù)在臨床上的發(fā)展卻遭遇了“不同語(yǔ)系”的尷尬。基因?qū)用?、分子水平?duì)于疾病的診斷與此前在病癥水平的診斷很可能完全不同。

缺標(biāo)準(zhǔn):數(shù)據(jù)質(zhì)量影響報(bào)告準(zhǔn)確性

中國(guó)食品藥品檢定研究院副院長(zhǎng)王佑春研究員用“五多”表示下一代基因測(cè)序技術(shù)走向標(biāo)準(zhǔn)化應(yīng)用的難處?!芭c傳統(tǒng)診斷技術(shù)相比,下一代基因測(cè)序技術(shù)檢測(cè)靶點(diǎn)多、通量高、數(shù)據(jù)量多、分析流程多、質(zhì)量控制參數(shù)多。”這意味著用“整齊劃一”要求每一個(gè)檢測(cè)程序是艱難的。

王佑春簡(jiǎn)要解釋了測(cè)序技術(shù)的內(nèi)容:“下一代基因測(cè)序的診斷由實(shí)驗(yàn)室操作和生物信息學(xué)分析組成,實(shí)驗(yàn)操作部分包括核酸提取、靶序列擴(kuò)增或捕獲,信息學(xué)分析包括讀取數(shù)據(jù)、過(guò)濾數(shù)據(jù)、拼接序列、比對(duì)解讀以及結(jié)果報(bào)告。”

由于測(cè)序的復(fù)雜性,對(duì)其質(zhì)量評(píng)價(jià)面臨著許多挑戰(zhàn)。此外,與傳統(tǒng)診斷技術(shù)相比,測(cè)序技術(shù)包括的生物信息學(xué)分析部分是此前所未有的,這要求創(chuàng)建新領(lǐng)域的標(biāo)準(zhǔn),例如創(chuàng)建數(shù)字參考品,包括標(biāo)準(zhǔn)序列或由其組成的標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)庫(kù)等。王佑春表示,“當(dāng)創(chuàng)建標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行引導(dǎo),企業(yè)才知道應(yīng)如何生產(chǎn)這樣的試劑,促進(jìn)產(chǎn)業(yè)走向規(guī)范化?!?/p>

由于標(biāo)準(zhǔn)的缺失,目前我國(guó)在基因檢測(cè)的數(shù)據(jù)質(zhì)量上令人擔(dān)憂。楚文江此前與國(guó)內(nèi)生物企業(yè)洽談合作后表示,在數(shù)據(jù)質(zhì)量控制方面國(guó)內(nèi)做的還遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠。如果數(shù)據(jù)錯(cuò)了,后期分析、結(jié)果都是在浪費(fèi)時(shí)間。

呼喚監(jiān)管:保障科學(xué)性項(xiàng)目最終勝出

“嚴(yán)格的監(jiān)管表面看起來(lái)似乎阻礙創(chuàng)新,但它可以保證真正具有科學(xué)性的項(xiàng)目最終勝出?!背慕J(rèn)為,中國(guó)的監(jiān)管和行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)相對(duì)比較寬松,早期發(fā)展迅猛,但在一定的時(shí)期內(nèi)需要撥亂反正,要防止醫(yī)學(xué)創(chuàng)新被市場(chǎng)綁架。

據(jù)2015年底全國(guó)性的腫瘤二代測(cè)序?qū)嶒?yàn)室質(zhì)量評(píng)估報(bào)告結(jié)果顯示,其中55%的實(shí)驗(yàn)室是不合格的,甚至22%的實(shí)驗(yàn)室居然得到的是0分。而中國(guó)食品藥品檢定研究院最近做過(guò)的一項(xiàng)樣本封盲檢測(cè)顯示,國(guó)內(nèi)4家測(cè)序企業(yè)對(duì)于同樣的樣本給出的診斷結(jié)果并不一致。楚文江認(rèn)為,目前中國(guó)的基因檢測(cè)還沒(méi)有成熟完整的質(zhì)量監(jiān)管體系,體現(xiàn)在數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性上沒(méi)有保證。而美國(guó)則調(diào)動(dòng)聯(lián)邦政府層面比如美國(guó)食品藥品監(jiān)督管理局和美國(guó)聯(lián)邦醫(yī)療保險(xiǎn)和醫(yī)療救助服務(wù)中心,州政府層面比如各州公共衛(wèi)生部門,以及行業(yè)協(xié)會(huì)等進(jìn)行多重質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)和監(jiān)管。

與楚文江的觀點(diǎn)相似,中國(guó)食品藥品檢定研究院劉東來(lái)等此前撰文梳理了美國(guó)對(duì)實(shí)驗(yàn)室研發(fā)診斷試劑的監(jiān)管之路,文章指出,醫(yī)療機(jī)構(gòu)此前未能得到明確監(jiān)管,直接導(dǎo)致了基因檢測(cè)市場(chǎng)的種種亂象,既無(wú)法保障消費(fèi)者或患者的切身利益,又無(wú)法真正地促進(jìn)技術(shù)創(chuàng)新和行業(yè)發(fā)展。

監(jiān)管需要回答的問(wèn)題包括:檢測(cè)者擁有什么的資質(zhì),采用什么樣的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn),是否定期進(jìn)行熟練測(cè)試等。楚文江認(rèn)為,這些都是患者關(guān)注的問(wèn)題。

越來(lái)越多的獨(dú)立實(shí)驗(yàn)室和公司都在進(jìn)行相關(guān)技術(shù)的研發(fā),這就導(dǎo)致了監(jiān)管范圍需要擴(kuò)大。這也是美國(guó)此前面臨的問(wèn)題。該如何應(yīng)對(duì)?對(duì)監(jiān)管者的考驗(yàn)仍在繼續(xù)。


2019年7月25日-27日,億歐大健康將主辦“GIIS 2019第四屆中國(guó)大健康產(chǎn)業(yè)升級(jí)峰會(huì)”,峰會(huì)以“雁棲健談——從【規(guī)?!康健緝r(jià)值】的醫(yī)療變革”為主題,圍繞醫(yī)療大數(shù)據(jù)、醫(yī)藥創(chuàng)新、非公醫(yī)療和科技醫(yī)療四大細(xì)分領(lǐng)域的市場(chǎng)環(huán)境、投資熱點(diǎn)和產(chǎn)業(yè)變革等話題展開探討。

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