何謂脫靶?通俗點(diǎn)說,科學(xué)家們本來要對目標(biāo)基因A進(jìn)行“手術(shù)”,結(jié)果陰錯陽差地敲掉了基因B,從而釀成不可預(yù)知的安全風(fēng)險。然而懸在頭頂?shù)倪@把“達(dá)摩克利斯之劍”,看不見、摸不著,一直讓生物學(xué)家們戰(zhàn)戰(zhàn)兢兢,卻又無可奈何。
基因脫靶:
懸在頭頂?shù)摹斑_(dá)摩克利斯之劍”
但一個尷尬的現(xiàn)實(shí)是,CRISPR/Cas9問世以來,其脫靶風(fēng)險一直存在?!叭绻麑RISPR/Cas9及其衍生工具用于臨床的話,脫靶效應(yīng)可能會引起包括癌癥在內(nèi)的多種副作用?!敝袊茖W(xué)院神經(jīng)科學(xué)研究所研究員楊輝告訴經(jīng)濟(jì)日報記者。
在此之前,人們推出過多種脫靶的方案。不過,以前的方法或者依賴于計算機(jī)軟件預(yù)測,可靠性無人得知;或者依賴于高通量測序檢測DSB產(chǎn)生;還有體外檢測的方法,會引入大量噪音,導(dǎo)致檢測精確度大打折扣。例如:無法高靈敏性檢測到脫靶突變,尤其是單核苷酸突變。因此,關(guān)于CRISPR/Cas9及其衍生工具的真實(shí)脫靶率,學(xué)術(shù)界一直存在爭議。
能否找到一種能夠突破之前限制的脫靶檢測技術(shù)?這成為CRISPR/Cas9及其衍生工具能否最終走向臨床的關(guān)鍵。
意外發(fā)現(xiàn):
單堿基突變技術(shù)存在嚴(yán)重脫靶風(fēng)險
理想很美好,現(xiàn)實(shí)很殘酷。如何提升檢測脫靶效應(yīng)的精度?答案是:徹底顛覆原有的脫靶檢測手段。
那么,千辛萬苦開發(fā)的新型脫靶檢測技術(shù)效果如何?實(shí)踐是檢驗(yàn)真理的唯一標(biāo)準(zhǔn)。
進(jìn)一步分析這些脫靶位點(diǎn),研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),有部分位點(diǎn)出現(xiàn)在抑癌基因上。這意味著什么?“經(jīng)典版本的BE3有著很大的隱患,目前不適合作為臨床技術(shù)。要知道,在此之前,以BE3為代表的單堿基突變技術(shù)一直被認(rèn)為是一種特別安全,幾乎不會存在脫靶問題的新技術(shù)。”楊輝說,盡管從基礎(chǔ)生物學(xué)理論上可以推斷出這些技術(shù)很可能存有脫靶問題,但當(dāng)時大家理所當(dāng)然地認(rèn)為它們很安全。
未來方向:
何謂脫靶?通俗點(diǎn)說,科學(xué)家們本來要對目標(biāo)基因A進(jìn)行“手術(shù)”,結(jié)果陰錯陽差地敲掉了基因B,從而釀成不可預(yù)知的安全風(fēng)險。然而懸在頭頂?shù)倪@把“達(dá)摩克利斯之劍”,看不見、摸不著,一直讓生物學(xué)家們戰(zhàn)戰(zhàn)兢兢,卻又無可奈何。
基因脫靶:
懸在頭頂?shù)摹斑_(dá)摩克利斯之劍”
但一個尷尬的現(xiàn)實(shí)是,CRISPR/Cas9問世以來,其脫靶風(fēng)險一直存在?!叭绻麑RISPR/Cas9及其衍生工具用于臨床的話,脫靶效應(yīng)可能會引起包括癌癥在內(nèi)的多種副作用?!敝袊茖W(xué)院神經(jīng)科學(xué)研究所研究員楊輝告訴經(jīng)濟(jì)日報記者。
在此之前,人們推出過多種脫靶的方案。不過,以前的方法或者依賴于計算機(jī)軟件預(yù)測,可靠性無人得知;或者依賴于高通量測序檢測DSB產(chǎn)生;還有體外檢測的方法,會引入大量噪音,導(dǎo)致檢測精確度大打折扣。例如:無法高靈敏性檢測到脫靶突變,尤其是單核苷酸突變。因此,關(guān)于CRISPR/Cas9及其衍生工具的真實(shí)脫靶率,學(xué)術(shù)界一直存在爭議。
能否找到一種能夠突破之前限制的脫靶檢測技術(shù)?這成為CRISPR/Cas9及其衍生工具能否最終走向臨床的關(guān)鍵。
意外發(fā)現(xiàn):
單堿基突變技術(shù)存在嚴(yán)重脫靶風(fēng)險
理想很美好,現(xiàn)實(shí)很殘酷。如何提升檢測脫靶效應(yīng)的精度?答案是:徹底顛覆原有的脫靶檢測手段。
那么,千辛萬苦開發(fā)的新型脫靶檢測技術(shù)效果如何?實(shí)踐是檢驗(yàn)真理的唯一標(biāo)準(zhǔn)。
進(jìn)一步分析這些脫靶位點(diǎn),研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),有部分位點(diǎn)出現(xiàn)在抑癌基因上。這意味著什么?“經(jīng)典版本的BE3有著很大的隱患,目前不適合作為臨床技術(shù)。要知道,在此之前,以BE3為代表的單堿基突變技術(shù)一直被認(rèn)為是一種特別安全,幾乎不會存在脫靶問題的新技術(shù)?!睏钶x說,盡管從基礎(chǔ)生物學(xué)理論上可以推斷出這些技術(shù)很可能存有脫靶問題,但當(dāng)時大家理所當(dāng)然地認(rèn)為它們很安全。
未來方向: